Produits

Banques de produits

Greenpharma offre plusieurs types de banques de composés selon vos besoins. Notre objectif est que vous trouviez des hits quel que soit la nature des tests. Pour cela, nous avons mis l’accent sur la sélection méticuleuse des composés. Ainsi nous proposons plusieurs produits selon vos besoins.

PRODUITS

UTILISATIONS POSSIBLES

Chimiothèque de molécules naturelles (GPNCL) Recherche de touches
Chimiothèque de ligands humains (LIGENDO) Recherche de touches, « déorphelisation » de récepteurs, chémogénomique
Extraithèque de plantes (GPEL) Recherche de touches (mélanges synergiques) et de nouveaux familles chimiques

Nous pouvons également concevoir des banques de produits à façon.

Chimiothèque de molécules naturelles (GPNCL)

La GPNCL combine notre expertise en chimie médicale et chémoinformatique, et nos connaissances en pharmacognosie pour créer une source unique de composés purs et divers, pour la découverte de touches et de têtes de série.

Pour concevoir cette chimiothèque, nous avons rassemblé 150 000 structures de composés naturels dans notre base de données et utilisé des outils chémoinformatiques pour ainsi sélectionner un sous-ensemble de molécules chimiquement diverses et « drug-like ».

Nous avons écarté les acides aminés, peptides, acides nucléiques, les acides gras à chaîne longue ainsi que les métaux.

Nous avons pris soin de sélectionner différentes familles phytochimiques, dans l’idée de représenter le plus de familles chimiques possible.

Un stock de chaque molécule est conservé pour le réapprovisionnement.

Les composés de la chimiothèque sont des composés naturels, des informations sur la provenance des molécules sont fournies (famille, gènes, espèces, organe…)

Les applications:

Hit to lead, chémogénomique

Les avantages :

Diversité chimique importante, molecules « drug-like », possibilité de réapprovisionnement

Caractéristiques techniques :

Chaque plaque contient 80 molécules. Chaque puits contient 500 µL de solution DMSO à 5mM en produit. Cette forte concentration permet facilement d’effectuer des dilutions jusqu’à atteindre des concentrations s’affranchissant des effets du DMSO.

  • Pureté supérieure à 90%
  • Diversité chimique
  • « Drug-like »
  • Possibilité de personnaliser la chimiothèque

Données fournies :

Notre produit est fourni avec un fichier électronique (SDF, XLS ou PDF) contenant le nom des différentes molécules, ainsi que leur structure et position sur la plaque. Ce fichier contient également les sources biologiques connues de chaque composé, et des descripteurs physico-chimiques calculés.

Propriétés physico-chimiques et distribution phytochimique :

Le tableau suivant représente le profil physico-chimique et la distribution des molécules de GPNCL d’un point de vue phytochimique. Les alcaloïdes représentent la famille la plus conséquente de la chimiothèque puisqu’ils représentent la famille phytochimique la plus diverse en terme de structure suivis par les terpenes.

Chimiothèque de ligands humains (LIGENDO)

LIGENDO allie l’expertise de Greenpharma en chimie médicinale et chémoinformatique, et ses connaissances sur les produits naturels pour créer une unique source de composés purs pour la chémogénomique et la découverte « voies biologiques alternatives ». Ces 400 ligands endogènes humains sont sélectionnés par diversité moléculaire.

Le stock de chaque molécule est maintenu pour assurer les futurs approvisionnements. Les composés sont des composés naturels authentiques.

Utilisation:

hit & lead, chimiogénomique, repositionner de médicaments, recherche de voies biologiques alternatives

Les avantages :

Diversité chimique, métabolites (donc « bio-compatibles »), possibilité de réapprovisionnement, connaissance des voies biologiques, prédictions de propriété biologique

Caractéristiques techniques :

Chaque plaque contient 80 molécules. Chaque puits est rempli de 500 µL de solution DMSO, et la concentration en molécule est de 1mg/mL. En tenant compte du poids moléculaires moyens, nous estimons la concentration à 5 mM. Cette forte concentration permet facilement d’effectuer des dilutions jusqu’à atteindre des concentrations s’affranchissant des effets du DMSO.

  • Pureté supérieure à 90%
  • Diversité chimique
  • « Metabolite-like »
  • Possibilité de personnaliser sa chimiothèque

Données fournies :

Une base de données est fournie avec la chimiothèque. Elle décrit le contenu de chaque puits : le nom du composé, sa structure, la voie métabolique impliquée, le numéro EC des protéines qui interagissent avec la molécule, les propriétés physico-chimiques calculées, ainsi que les protéines qui pourraient interagir avec la molécule, identifiées grâce à l’outil Selnergy.

Propriétés physico-chimiques :

Les molécules de cette chimiothèque sont constituées d’hormones, de vitamines ou précurseurs et co-facteurs, de dérivés peptidiques, d’acides gras et de carbohydrates (voir ci-dessous le profil physico-chimique)

Extraithèque de plantes (GPEL)

Cette extraithèque est le fruit de notre expertise en produits naturels et nos connaissances en pharmacognosie, pour créer une source unique d’extraits naturels originaux et divers, pour le criblage et la découverte de nouvelles molécules.

Cette extraithèque inclut notre savoir-faire en ethnobotanique, botanique, pharmacologie, chimie organique et analytique et nous permet ainsi de proposer une gamme d’extraits aussi large que possible.

Le processus de sélection se base sur la diversité taxonomique et le biotope. De plus, des critères de brevetabilité sont ajoutés pour assurer l’originalité de la plante sélectionnée. Chaque plante est stockée pour que le réapprovisionnement soit assuré dans les plus brefs délais.

Utilisation

hit & lead, découvertes d’extraits actifs (« botanicals »).

Avantages

Diversité chimique se reflétant dans la biodiversité, potentielle source de nouveaux scaffolds.

Caractéristiques techniques

La GPEL possède un format adapté au criblage à haut débit (HTS). Chaque microplaque contient 80 extraits représentant 20 plantes. Chaque extrait est présent dans 4 solvants aux polarités différentes. Chaque puits contient 2mg d’extrait dilué dans 200 µL de DMSO. Cette forte concentration permet facilement d’effectuer des dilutions jusqu’à atteindre des concentrations s’affranchissant des effets de la toxicité du DMSO.

Données fournies

Un fichier est fourni avec le produit (format XLS ou PDF). Il décrit le contenu de chaque puits et apporte des informations sur la famille de plantes, le genre, l’espèce et l’organe.

Distribution

Nous avons sélectionné les plantes par biodiversité pour couvrir un maximum de taxons  d’environnements différents. Ainsi sur les 200 espèces de plantes, nous avons 187 genres   correspondant à 80 familles.

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